ChIP-Seq

技術(shù)簡介

染色質(zhì)免疫共沉淀測序 (Chromatin immunoprecipitation sequencing，ChIP-Seq) ，是在全基因組范圍內(nèi)尋找與目的蛋白特異結(jié)合的DNA位點(diǎn)、組蛋白修飾位點(diǎn)和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)等，為全面解析基因調(diào)控、蛋白質(zhì)與DNA互作提供了有效的技術(shù)手段。

送樣建議

技術(shù)參數(shù)

案例分析

GATA蛋白家族在細(xì)胞重編程過程中的作用機(jī)制研究

研究背景            

譜系分化轉(zhuǎn)錄因子 (GATA家族) 可以代替多能因子 (Oct4) 來完成細(xì)胞重編程過程，但其具體作用機(jī)制仍不清楚。

研究目的

研究人員通過對小鼠細(xì)胞進(jìn)行RNA-Seq和 ChIP-Seq  研究和組合分析，揭示GATA家族在動物細(xì)胞重編程過程中的關(guān)鍵作用。

研究結(jié)果

所有的6類GATA轉(zhuǎn)錄因子（GATA1~6），是C端（羧基端）具有保守的DNA結(jié)合域的鋅指蛋白，在細(xì)胞重編程過程中均可以直接結(jié)合并激活 Sall4 基因的多能性。進(jìn)一步證實(shí)了GATA 家族在細(xì)胞重編程過程中的重要作用機(jī)制。

Sall4 在GATA 家族誘導(dǎo)細(xì)胞重編程過程中起重要橋梁作用

參考文獻(xiàn)

[1]. Shu, J.  et al. GATA family members as inducers for cellular reprogramming to pluripotency. Cell Res, 2015, 25:169-180, doi:10.1038/cr.2015.6.